kuroの覚え書き

96の個人的覚え書き

2017-05-08から1日間の記事一覧

RNA-seqのデータ処理自動化

自動化される手順 FastQCでクオリティーチェック→トリミングのためのパラメータを決める(ただし今回は機械的に連続処理してしまう) fastq_quality_trimmerでトリミング #パラメータは切り取るクオリティスコアとフラグメント長 トリミング後のクオリティ…

シェル小ネタ

Mac

.bashrcに変更入れたあと、ログアウトせず有効化するには $ source ~/.bashrc~にスクリプトなどの置き場(~/bin)を作ってパスを通しておく(.bashrcに書いておく) if [ -d $HOME/bin ] then PATH=$PATH:$HOME/bin; export PATH fiデフォルトではターミナル…