kuroの覚え書き

96の個人的覚え書き

2017-05-11から1日間の記事一覧

RNAseqパイプライン4 cummeRbund

Rでゴニョゴニョ >library("cummeRbund") >setwd("~/") #作業ディレクトリを適当に指定 >cuff <- readCufflinks("hogehoge/tophat_results/cuffdiff_result") >my.genes <- genes(cuff) #遺伝子発現量情報を取り出し >ddr <- csDendro(my.genes) #取り出した…

R のキホン

Rのキホンのキホン <- 代入 (シェルで言うところの = と同等) > a <- "b" #文字は""で挟む データ型は"character" > a [1] "b" #文字は""で挟まれて返る > c <- 5 #数字はそのまま データ型は"numeric" > c [1] 5 #数字はそのまま返る > d <- TRUE #論理値は…