kuroの覚え書き

96の個人的覚え書き

2017-05-19から1日間の記事一覧

RNAseqデータの解析

パイプラインで seqリードをゲノムにマッピング(tophat) 各サンプルの遺伝子発現量FPKMを計算(cufflinks) サンプル間のFPKMを比較(cuffdiff) とデータ処理をしてきたが、結局肝心なのはここで吐き出されたデータをいかに解釈し、意味を見出すかということ。t…