どれもこれもうまく動かないのでふてくされてても仕方がないので、一番最新のCASHを試してみる。 javaなようなので java -jar -Xmx8g ~/local/bin/cash_v2.1.0-alpha1/cash.jar --Case:prefix1 case.bam --Control:prefix2 Control.bam --GTF genes.gtf --Ou…

なにやらcummeRbundが使えなくなった。急に。 cuffdiffのデータ処理をミスったかと思ったが、以前に解析したデータでも同じエラーが出て止まってしまう。 > cuff <- readCufflinks("~/expression/SRSF10/hisat_results/cuffdiff_result") Creating database …