2018-06-04から1日間の記事一覧
mappingを行ったbamファイルから更に絞り込みをかけてやる。 具体的にはSNV、INDELを持つreadを取り除いて100%matchしたreadだけにしたい。基本はsamtools viewでbamを開いて、grepやawkで整形をすることになるだろう。bamはバイナリなので中身が見れないが…
mappingを行ったbamファイルから更に絞り込みをかけてやる。 具体的にはSNV、INDELを持つreadを取り除いて100%matchしたreadだけにしたい。基本はsamtools viewでbamを開いて、grepやawkで整形をすることになるだろう。bamはバイナリなので中身が見れないが…