kuroの覚え書き

96の個人的覚え書き

Network

Macを起動したら自動でsshfsでマウント

まずはサーバの側の公開鍵・秘密鍵を設定秘密鍵をmacの側で~/.ssh/kuro-server などの名前で保存しておく /usr/local/bin/sshfs kuro@192.168.1.100:/home/kuro ./mnt -o IdentityFile=~/.ssh/kuro-serverというスクリプトをautomatorで作成してアプリとして…

VALUE-SERVERにRedmine

うまくいかないよー libcのバージョンが古すぎるからbrewでインストールしたけど、そっちを使ってくれない。

value serverでレンタルサーバー

某大学内でサーバを建ててあれこれやっているが、外部からアクセスできるようには、なかなかさせてもらえないので、学外にサーバを建てることにした。 といっても、物理サーバを管理することもできないので、レンタルサーバでお茶を濁す。 とにかく料金が安…

NETGEAR GS716Tv3でVLAN その2 自作LANケーブルを疑え

とりあえずの設定ができて2つのVLANにclusterとLANを分離したのだが、なにやら挙動が安定しない。 LANから外のウェブにアクセスしようとするとどういうわけかpublicではなくinternalの方から接続しようとして つながらなかったり、逆にネットにはつながるの…

wgetでディレクトリごとダウンロード、でもparent directoryはいらないよ

$ wget -r -np http://hogehoge.com/huga/

NETGEAR GS716Tv3でVLAN

なかなか設定に苦労した。 最終的に一番参考になったサイトは beginners-network.com若干機種が違うのでメニュー項目が違っているのだがまず Switching>VLAN>Advanced>VLAN Configuration で、分けたい分のポートのためのVLANを作る。2つに分けたいならとり…

UPSを導入ーterastationとサーバの両方を連動してシャットダウンー

停電や不慮の電源トラブルに備えてオムロンのUPSを導入した。全サーバー群の電源を確保できるような大容量のUPSは高価なため、WEBサービス用データを保持しているヘッドノードとNFSサーバとして使っているTeraStationだけでもつないでおけるようにと、750Wの…

Safari12でプラグインが使えなくなったときWEB認証のVPNをどうやって使うか

どうやらSafariがバージョンアップし、adobe flash player以外のプラグインがことごとく使用不能になったらしい。 そこで困ったのが大学のサーバへのVPN接続。 webからVPN接続のための認証を行っていたのに、mac_sslvpnが使えなくなって接続できなくなった。…

NFSとNISがポートを取り合い

あるとき再起動したあと、NISクライアントがuserを受け付けてくれなくなり、ちょっと途方に暮れる。 NISサーバがどういうわけか起動していないので再起動してみたが、エラーが出て起動してくれない。 systemd[1]: Starting NIS/YP (Network Information Serv…

PXE bootでTeraStationが繋がらない

CentOS7でPXEサーバを立ててディスクレスブートを試しているのだが、どうにもNASのTeraStationがマウントできない。 マシンスペックが異なるがHDDでブートしているノードからはNFSで普通にマウントできているのだが。 どうしても mount.nfs: timeout set for…

PXEブートのまとめ

PRIMERGY RX200をネットワークブートでディスクレス運用するまとめ。まず、クライアント側でPXEブートに使うネットワークポートを確認し、BIOSでPXE enableに設定する。PRIMERGYの場合デフォルトで1つのポートだけPXE対応に設定されているはず。(2つ両方…

XEON覚書

富士通 PRIMERGY RX200S6 xeon E56xx (Nehalem もしくはWestmere) 同世代のNEC→Expres5800/R120a-1 xeon E55xx, Expres5800/R120b-1 xeon E55xx, E56xx富士通 PRIMERGY RX200S7 xeon E5-26xx (Sandy Bridge) 同世代のNEC→Expres5800/R120d-1 xeon E5-24xx, …

TORQUEつづき

どうもちゃんと動いていないような気がしてならないので、いろいろテストしてみる。 $ echo "sleep 30" | qsub -l nodes=1:ppn=8こういうふうにジョブを投げると $ qstat -t Job ID Name User Time Use S Queue ------------------------- ---------------- …

TORQUEとopenMPIをインストール

TORQUEのインストールは以前やった通り。3ノードがstatus: freeで認識された。せっかくなのでmpiも入れてベンチマークなどもしてみたいのだが。 # yum install -y openmpi openmpi-develすべてのノードにインストール 使用するユーザ(root以外)についてPAT…

WOLの設定/NFSでマウントしたままシャットダウンしようとすると固まる

使用しないときの計算ノードを止めておこうと思う。かといって計算するときにわざわざサーバルームまで行くのは面倒だし、遠隔地から作業できないし、ということでwake on LANを試してみる。 起こしたいサーバに # yum install ethtoolとソフトウェアをいれ…

php MARIADB phpmyadminのインストール

前にもやったが、記憶が曖昧になっているため、整理。まずはphpのインストールから。 # yum install epel-release # rpm -Uvh http://rpms.famillecollet.com/enterprise/remi-release-7.rpm # yum install --enablerepo=remi,remi-php70 php php-mbstring p…

NFS/NISによるユーザの共通化

ディスクレスについてはまだちょっとハードルが高いので、とりあえず各サーバにRAID1でディスクを配置してシステムをインストールした。そのままではそれぞれのサーバにソフトウェアをインストールしたり使い勝手がイマイチなのでNFSでヘッドノードのディレ…

ディスクレスブート再び

ヘッドノードも入ったことだし、古いサーバーはディスクレスにしてやることで安定動作&消費電力の節約を図りたい。流石に5年以上使ったSASの15krpmディスクなんていつ壊れてもおかしくないので。実際1個壊れかけていたし。ということでヘッドノードにdhcp…

AirMac extremeのtime capsuleをCentos7にマウントする

sudo mount.cifs //192.168.xxx.xxx/ ~/airmac(マウントポイント) -o sec=ntlm,password=xxxxxxxxxxx これでマウントOK

TeraStationのNFSの設定

アマゾンで超破格で12TBのTeraStationが売っていたので、怪しいと思いつつも導入してみた。ラックマウントの4HDDのNASで、HDD無しで売っている某メーカーの価格くらいで3TBx4ついてきた感じ。 早速設定をしてNFSでマウントしてみると、どうも挙動がおかし…

NFSで解析用ディレクトリを共有する

serverが2台になったのでとりあえず一つのディスク領域を共有してデータ解析を分散させたい。そのために入出力するデータの置き場は1箇所にまとめておきたいのでnfsサーバを立ててそこに共有フォルダを置く。 server2(10.0.1.101)にnfsサーバーを立て、serve…

TORQUEジョブスケジューラをインストールする。

最終的にはヘッドノードを独立させて、計算ノードはネットワークブートで運用しようと思うが、まずは2ノードでそれぞれHDDでブートして一方がヘッドノードも兼ねるという構成で構築実験をしてみようと思う。https://qiita.com/yf_xa/items/6042619a5d1a3decf…

サーバのネットワークをうまく組みたい

現状の整理 イントラネットには現状無線LANルータ設置しか申請してないので、サーバも無線LAN下にある。 更に、居室にサーバを置けないので、別室に設置している関係で、無線LANルータからは中継機でwifiを飛ばし接続という回りくどさ。 さらに、server2はHD…

IPマスカレード

ずいぶん昔、まだ世の中にネットワークルータというハードウェアがほとんどなく、あったとしてもマニアックな超高級品であった時代、Linux-boxをルータとして使うIP-Masqueradeを組んだ・・・というのがLinuxとの最初の出会いであったなあ・・・(遠い目時代…

クラスタにするかただの並列にするか

https://qiita.com/yubais/items/7c40227a17569dc9d412http://www.kurobuti.com/linux_server/?page_id=58 ディスクレスクライアント https://www.server-world.info/query?os=CentOS_7&p=pxe&f=4まずは入れてみる。 最初に導入したサーバーのイーサネットポ…

DDBJスパコン運用〜ファイル転送2

大量のデータをやり取りしたいときはASPERAで行うのがいいが、ちょっとしたファイルをアップロードダウンロードするならsshfsでディスクをマウントしてしまうのが手っ取り早い。 コマンドラインでマウントポイント ~/ddbjにマウントするには $ sshfs usernam…

sshの活用

https://qiita.com/ik-fib/items/0af46a19e3083bb0325e まだまだ使いこなせてなかった技が色々。手始めにDDBJのスパコンのUGEのモニタリングを行うqmonを試す。 これはsshでアクセスする際に-Yオプションを付けておくだけでよい。 $ ssh -y gw2.ddbj.nig.ac.…

DDBJスパコン運用〜ファイル転送

DDBJのスパコンのアカウントを取ったのだけど、その環境整備をやっている時間が取れなかったので、そのまま放置していた。ようやくちょっと時間が取れたのでアクセスしてみようと思ったら、メンテナンスで停止していて入れないし。 ようやくメンテが終わった…

Google Compute Engineを使ってみる

遺伝研のスパコンアカウントを取ったので、重いデータ解析はこっちでやるといい。ただwebサーバを立てたり外向けのサービスをやるには色々申請がいるようで面倒そうだ。 何より、今日使おうとしたら定期メンテナンスとかで1週間もスパコンがダウンしててアク…

ホームページ制作つづき

昨日着手したホームページだが、とりあえず入力完了。結局テキストエディタでひたすらタグを打って完成。 cssとjavascriptの大半をBootstrapテンプレートに任せたおかげで、ほぼ1日半で研究プロジェクトの公式HPの形が出来上がった。まあ、もうちょっと色合…