FastQCのコマンドを入れる際 #!/bin/sh list="exp1 exp2 exp3" mkdir -p ./FastQC for file in $list do fastqc -t 8 -q --nogroup -o ./FastQC ./"$file"_1.fastq.gz fastqc -t 8 -q --nogroup -o ./FastQC ./"$file"_2.fastq.gz doneこんな感じだけど "$fi…

exp1という実験のfastqファイルをQCすると exp1_1_fastqc.html exp1_1_fastqc.zip exp1_2_fastqc.html exp1_2_fastqc.zip の４つのファイルができる。 htmlファイルをブラウザで開けばそれぞれ個別にチェックできるが、大量のデータをいちいち開くのは勘弁し…