http://bioinf.wehi.edu.au/subread-package/SubreadUsersGuide.pdf を参考に。 $ ~/local/bin/subread-1.5.2-MaxOSX-x86_64/bin/featureCounts -T 4 -a ~/expression/Homo_sapiens/NCBI/build37.2/Annotation/Archives/archive-2014-06-02-13-47-29/Genes/g…

気がついたこと、覚えとこうと思うこと、shellとの相違点など。 文字列と変数の扱い 出力 print() ←シェルスクリプトだとecho (ちょっと違うけど） 文字列は" "か’ ’でくくる（どっちでも良いが' 'の中では””は文字となり、逆も然り。アポストロフィーを使う…

python php+SQL R これらを実用域で使えるようにする。pythonはまあshellよりはperlやRに近い文法っぽいな。 php+SQLは昔、MAMP(もしくはXAMPP)に手を出していたから大まかな概念は知っているつもりだったが、まあ既成のツールをいじっていただけだったので…