kuroの覚え書き

96の個人的覚え書き

2018-03-06から1日間の記事一覧

DDBJのスパコンアカウントが使えるようになった。

早速、ssh→qloginでログインノードまで進む。 何が使えるかな? Python3 OKだな。 $ pip3 list biopython (1.66) cutadapt (1.9.1) cycler (0.10.0) drmaa (0.7.6) Genshi (0.7) matplotlib (1.5.1) nose (1.3.7) numpy (1.10.4) Pillow (3.1.1) pip (8.1.0)…

in_()に入るlistのサイズは最大で999らしい

あるqueryを組み立てて、結果出てくるものからlistを作って、そのlistに含まれるものをin_()を使って別のqueryの中でfilterしたいと思った。 q = session.query(Rna_snp) snp = q.distinct(Rna_snp.snp_hash).group_by(Rna_snp.snp_hash)snp.all() snp_list …