アノテーションデータベースが作りたいので、A種のgene aについてB種の遺伝子をBLASTで調べて、一番上に来るものを1:1対応させたい。http://bioinfo-dojo.net/2016/03/25/blast_besthit_outfmt7/ ここにあるように、blastの結果から1行目だけをawkで取り出す…

バイオインフォマティックスをやってるならBLASTくらい自分で構築しないとな、 というわけでもないけど、やはりアノテーションデータベースを構築したいので、blastをMacに入れることにする。 さらっとぐぐってみたらHomebrewで行けそうなので $ brew instal…

大量のデータをやり取りしたいときはASPERAで行うのがいいが、ちょっとしたファイルをアップロードダウンロードするならsshfsでディスクをマウントしてしまうのが手っ取り早い。 コマンドラインでマウントポイント ~/ddbjにマウントするには $ sshfs usernam…