kuroの覚え書き

96の個人的覚え書き

2018-04-19から1日間の記事一覧

fastaから配列を取り出す

$ samtools faidx genome.fasta chr1:15,000-50,000 こんな感じでfastaファイルから取り出したい配列を指定して取り出すことが可能。 ある遺伝子を特定したとして、その上流プロモーターの配列をfastaから取り出したいなどの用途で使える。 また $ samtools …