kuroの覚え書き

96の個人的覚え書き

2018-05-21から1日間の記事一覧

テスト運転

さて、早速 見せてもらおうか、富士通の中古サーバーの性能とやらを (注:ガ◯ダ◯って実は殆どみたことないんだが)大体270MBくらいのfastq.gzファイルを4つ trimmomatic SE \ -threads $cpu -phred33 -trimlog log.trimlog \ ./fastq_files/"$samp"_"$exp"…

CentOS7にNGS関連のソフトウェアをインストール

まずとにかくyumでwgetとnanoだけは入れておく。そのうえでlinuxbrewを入れてしまえば、ほぼ問題なく殆どの環境が構築できてしまった。 http://linuxbrew.sh Linuxbrewのインストール方法は上のサイトのままでOK幾つかのソフトは $ brew tap brewsci/science…