2019-02-19から1日間の記事一覧
multi fastaファイルを1個ずつのfastaに分割したい。 まずはfastaのseq部分の改行をなくす $ awk -v ORS= '/^>/ { $0 = (NR==1 ? "" : RS) $0 RS } END { printf RS }1' fasta.txt > fasta_awk.txt次にfastaを2行ごとに分割。多数のファイルが同じ階層にで…
multi fastaファイルを1個ずつのfastaに分割したい。 まずはfastaのseq部分の改行をなくす $ awk -v ORS= '/^>/ { $0 = (NR==1 ? "" : RS) $0 RS } END { printf RS }1' fasta.txt > fasta_awk.txt次にfastaを2行ごとに分割。多数のファイルが同じ階層にで…