kuroの覚え書き

96の個人的覚え書き

2019-05-15から1日間の記事一覧

multi FASTA (DNA)からmulti FASTA (Amino Acid)を機械的に作成する(その2)

ちょっと調べたらいけそうな気がしてきた。Biopythonを使うといろいろ簡単にできる模様。まずはmultifastaを開いて配列を順番に読み込む import sys from Bio import SeqIO fasta_file = sys.argv[1] for record in SeqIO.parse(fasta_file, 'fasta'): ids =…