連番で同じ処理をさせるためのリストを作る

ファイルを連番を付けて作成していてそれに同じ操作を全部やるとき、excelで編集してコマンドリストを作っていたが、shellでやるほうが簡単なので、その覚え書き

seq -w 0 42 | xargs -i echo "python3 seq.py TAIR10_cdna_20101214_updated.fa.split/TAIR10_cdna_20101214_updated.part_0{}.fasta > TAIR10_{}.txt" > com.txt

たとえばこのように42分割したfastaファイルにそれぞれある処理を実行する。