Programing
これまでタイムラプスカメラはラズパイベースで作ってきたが、もっと省電力で大量にばら撒くような使い方が必要となってきたのでESP32ベースに移行を考えた。 Amazonを見ていると1000円くらいで2MピクセルのカメラがついたESP32基板が見つかるが、どれもこれ…
別途公開の通信プロトコルを使用し、お客様ご自身でソフトウェアを作成していただければシリアル通信が可能となります。その場合、オプションのシリアル通信ケーブル( T R - 0 7 C )が 必 要 で す 。 と取説には書かれているが、どこにも公開されている感じ…
ESP32はAVRのATMEGAに比べてえらくエネルギー効率がいいらしく、省エネということになっている。240MHzで動かしていてもそうらしいが、ここは最低速度の10MHzまで落としてやろう。その上でインターバル運転で間をsleepで過ごさせるともっといいらしい。 #inc…
というわけで、ESP32が使えるようになったので、早速アナログセンサーのロガーを作ってみる。関係がありそうなピンだけ書き出してみるとこんな感じ。 あとはポチポチとつないでプログラムを書く。 #include <Wire.h> #include <RTClib.h> #include <SPI.h> #include <SD.h> const int chipSe</sd.h></spi.h></rtclib.h></wire.h>…
いやー、久しぶりに（？）どハマりした。 前から気にはなっていたESP32というマイコンを使ってみようと秋月電子で売っている一番安いやつｗを買ってみた。 ESP32-WROOM-32E ＥＳＰ３２−ＷＲＯＯＭ−３２Ｅマイコンボード: マイコン関連 秋月電子通商-電子部品…
これまでデータベースアプリに仕込んだ解析プログラムの中間ファイルだったりダウンロードする解析済みファイルなどは各個人のプライベートフォルダに記録することにしていた。共有のフォルダにtempファイルを落とすようにすると、複数人でアクセスしたとき…
Pythonでは映像周りはopenCVで扱うのが良いようだ。 $ sudo apt install python3-opencvcv2モジュールを読み込んであれこれするようだ。 $ python3 Python 3.8.10 (default, Mar 15 2022, 12:22:08) [GCC 9.4.0] on linux Type "help", "copyright", "credit…
というわけで定番Irisでやってみよう。 import numpy as np import matplotlib.pyplot as plt import somoclu import pandas as pd %matplotlib inline from sklearn.datasets import load_iris iris = load_iris() X = iris.data Y = iris.target n_rows, n…
モデル植物としてはゲノムデータがあまり完璧でない植物を研究対象にしているためBlast検索も外部データベースサイトに頼らず自分でシークエンスデータをあちこちから集めてきて自分仕様のBlastサーバを立てている。 これまでのところ、まあ自分で見るだけだ…
というわけで2ヶ月のすったもんだの末、うちに帰ってきたJetson Nano 2GB。 左：帰ってきた２GB、右：買い足した4GB（B01)壊れる前はそもそもMacbookAirのACアダプタ（容量、定格上は十分なスペック）で起動できなかったところからすでに異常だったわけだが…
壊れたJetson Nano 2GBの保証交換がちっとも進まないまま２ヶ月が過ぎようとしている。ということでもう一台買っちゃった。それも４GB。 今回はアマゾンではなく、日本での正規代理店らしい菱洋エレクトロから購入。アマゾンより安い。 ryoyo-gpu.jp基板丸出…
とりあえず起動したらDHCPで拾ったアドレスなり、接続したESSIDなりを取得してLCDに表示させるようにしてみた。 #!/usr/bin/python3 # coding: utf-8 import subprocess import Adafruit_CharLCD as LCD import time # GPIO lcd_rs = 17 lcd_en = 27 lcd_d4 …
お遊びではあるが、Raspberry PiにキャラクタLCDをつけてみた。 お遊びなのであえてこじんまりしたLCDをつけてみる。＜液晶表示器(LCD）＞＜液晶表示器(LCD）LCM0802A 8文字×2行 バックライト 青＞1個＜led-180＞札幌貿易(Sapporo Boueki)Amazonこれと基本同…
まずは何はなくともV4L2 $ v4l2-ctl General/Common options: --all display all information available -C, --get-ctrl=<ctrl>[,<ctrl>...] get the value of the controls [VIDIOC_G_EXT_CTRLS] -c, --set-ctrl=<ctrl>=<val>[,<ctrl>=<val>...] set the value of the controls [VIDIOC_S_EXT_</val></ctrl></val></ctrl></ctrl></ctrl>…
タイムラプス映像のクオリティをあげるべくカメラを買ってもらった。ELP バリフォーカルレンズ USBカメラ 800万画素 フルHD ウェブカメラ 高解像度 2448P 超小型ウェブカメラ ソニーIMX179/プラグ＆プレイ/フリードライバー 2.8-12mmバリフォーカルレンズ Us…
自宅鯖で深層学習の学習環境を整えようと四苦八苦していて、私が主に使っているCentOS７に構築したkvm環境上のUbuntu18.04にNVIDIAのドライバやtensorflowをインストールするところまでやったわけだが。 結局kvmではビデオカードを仮想環境が使うとホストで…
さっきやっとこさJSONやらAjaxをつかってフロントエンドとバックエンドのやり取りを成功させたところだが、 気を良くしてReactにも手を出してみる。まずnpmってなんなん？ってとこからですよ。 Node.jsってのをまず入れるんですね。 $ sudo yum install cent…
最終的にここに落ち着いた。 {% extends "base.html" %} {% import "bootstrap/wtf.html" as wtf %} {% block title %}Freezer list{% endblock %} {% block head %} {{ super() }} <link rel="stylesheet" href="https://bossanova.uk/jspreadsheet/v4/jexcel.css" type="text/css" /> </link>
以前チョロっと眺めていたjExcelを使ってウェブアプリに冷凍庫管理表を作ってみる。 javascriptなのでじつはあまり得意ではない。 しかし使い方は結構簡単そうだ。（実は実用するには結構ハードルが高いことは後でわかる） 設置方法は基本HTMLファイルにjava…
以前より作っていたグラフ描画用ウェブアプリをバージョンアップしてつかいやすくした。 ボックスプロットやバーグラフに各要素点をかんたんに重ねることが可能になった。 これでNatureにも投稿し放題だね。いよいよExcelは必須ではなくなってきたな。
例えばStudent's T testをやるついでにグラフも描いとこうというような場合。 import pandas as pd import matplotlib.pyplot as plt df = pd.read_csv("./ttest.txt") des = df.describe() print(des) # plt.figure() des[des.index=='mean'].T.plot.bar(ye…
やはりRとはなかなか仲良くなれないな。といってPythonでサラサラ～っとコードを書けるのかというと、結局は本と検索でどうにかやっているわけだが。 紙媒体の本はとりあえず大まかな感じを掴むのに向いている。 というわけで参考にしている本を並べてみる。…
顕微鏡の画像データが蓄積してきているが、いまいち整理されてなくて、バラバラにCD-Rとかに保存されているので一元管理したい。 できればサムネイル付きでカタログ化しておいて、目的の画像をパラパラっと見つけ出せるようであればなお良い。ということでま…
先日入手したADBキーボードがどうも調子が悪い。チャタリングがひどいといえばそうなんだが、特定のキー入力がダブるというよりはランダムにダブる。 これはスイッチがへたれているというよりはキーボードのICか周辺の回路に問題があるんだろうと思う。いっ…
インタラクティブに生成されたhtmlファイルをFlaskで表示させようとしたところブラウザがキャッシュファイルを読みに行ってしまって、作り変えた結果が表示されない。 data = dir + "/data_" + datetime.datetime.now().strftime('%y%m%d%H%M%S') + ".html" …
clustalwでsequenceのアライメントをとると、テキストで.alnというファイルが生成されるが、文字の並びとアスタリスクではわかりにくいことが多い。 なのでclustalxだとかMEGAだとかで表示するとカラフルに色分けで表示できるのでぱっと直感的に分かるのだが…
さて、１キーのキーボードができたら今度はそれを複数にしていきたいわな。ということで４キーに拡張してみた。 #include "Keyboard.h" const int buttonPinA = 6; // input pin for pushbutton int previousButtonStateA = HIGH; // for checking the state…
Arduino Pro microはArduino Leonardoの互換基板で、今回入手したのは更にそのコピー商品である。このArduinoクローンの特徴としていわゆるArduino UNOなどスタンダードなシリーズがATMegaシリーズのAVRを使っているのと異なり、32U4というUSBインターフェイ…
Arduino Pro micro を入手したのでとりあえずLチカの儀。KKHMF 2個 Leonardo Pro Micro ATmega32U4 5V/16MHz ブートローダ マイクロ USB Pro Mini 開発ボード Arduinoに対応メディア:オンボードには電源直結のLEDとシリアルのインジケータLEDしか載ってない…
1000枚以上あるようなTIFF画像にImageJで一律の処理を行いたい。 とてもじゃないが手ではやってられないのでマクロを使って自動運転する。 File＞New>Text Window を開き、次のようなスクリプトを作成して、Runする。 from ij import IJ from ij.io import D…
