kuroの覚え書き

96の個人的覚え書き

primer設計でblast

適当に選んだ配列がoff targetを増幅しないか調べるためにblastnで検索するとき、普通にデフォルトでやっても何も引っかからない。
そんなときは

$ blastn -db ath -query ~/Desktop/act1_f.txt -word_size 7

のように-word_sizeオプションを付けると良い。