Pythonからshellスクリプトを実行するとして、shellに変数を渡したいときはどうすればいいのか?
cmd = "ls /data/file/folder/*/*.bam > list.txt" subprocess.call(cmd, shell=True)
この/data/file/folder/*/*.bamをPythonから引数として渡したい。
そういうときは
cmd1 = '/data/file/folder/*/*.bam' cmd = 'ls %s > list.txt' % cmd1 subprocess.call(cmd, shell=True)
こんな感じで変数展開するといい。