kuroの覚え書き

96の個人的覚え書き

Server

富士通PRIMERGY RX300S7で深層学習の学習環境を構築してみる

データ解析をする上で無視できない深層学習(deep learning)を使えるように勉強中なのだが、手元に実機があったほうがいろいろと試せて良いだろう、ということでサーバの1ノードを深層学習用GPUマシンにすることにした。 当初RX200S7 (XEON E5-2620 x2)の1U…

VALUE-SERVERにRedmine

うまくいかないよー libcのバージョンが古すぎるからbrewでインストールしたけど、そっちを使ってくれない。

value serverでレンタルサーバー

某大学内でサーバを建ててあれこれやっているが、外部からアクセスできるようには、なかなかさせてもらえないので、学外にサーバを建てることにした。 といっても、物理サーバを管理することもできないので、レンタルサーバでお茶を濁す。 とにかく料金が安…

3世代5CPU対決

RX1330M3 E3-1230 v6 3.5GHz 4C8T 224.0GFLOPS 18/11/06 13:06:26 [M::bwa_idx_load_from_disk] read 0 ALT contigs [M::process] read 1815774 sequences (80000053 bp)... [M::process] read 1833396 sequences (80000011 bp)... [M::mem_process_seqs] Pr…

UPSを導入ーterastationとサーバの両方を連動してシャットダウンー

停電や不慮の電源トラブルに備えてオムロンのUPSを導入した。全サーバー群の電源を確保できるような大容量のUPSは高価なため、WEBサービス用データを保持しているヘッドノードとNFSサーバとして使っているTeraStationだけでもつないでおけるようにと、750Wの…

3世代のサーバの能力を検証してみた

ベンチマークソフトを使ってもいいけど、実際に仕事に使うスクリプトを処理するのにかかる時間を計測したほうが意味があるだろう。 ということで、試しにBAMファイルをcufflinksにかけて遺伝子発現量を算出させてみた。 処理してみたBAMファイルは 1, 4.4GB…

XEON覚書

富士通 PRIMERGY RX200S6 xeon E56xx (Nehalem もしくはWestmere) 同世代のNEC→Expres5800/R120a-1 xeon E55xx, Expres5800/R120b-1 xeon E55xx, E56xx富士通 PRIMERGY RX200S7 xeon E5-26xx (Sandy Bridge) 同世代のNEC→Expres5800/R120d-1 xeon E5-24xx, …

サーバのネットワークをうまく組みたい

現状の整理 イントラネットには現状無線LANルータ設置しか申請してないので、サーバも無線LAN下にある。 更に、居室にサーバを置けないので、別室に設置している関係で、無線LANルータからは中継機でwifiを飛ばし接続という回りくどさ。 さらに、server2はHD…

CentOS7にすることにした。

CentOS6.2にて環境構築を試みるも、やっぱりちょっとあちこち古くて、構築に難儀しそうだったので、最新の7を入れることにした。そうしたところ自分の知っているコマンドと色々変わっているらしく、それはそれで色々苦労しそうな予感。まずはネットワークの…

自前鯖ゲット

というわけで出来心から中古ラックマウントサーバマシンを入手してしまった。 富士通のPRIMERGYシリーズで、5年保守期間が切れて市場に出たものの、大量に売れ残って投げ売りされている2010年ごろのモデル RX200 S6がそれだ。 http://jp.fujitsu.com/platfo…